まずは耐久性です。 
 
長尺シートは商業施設に使われることもあり、土足OKなくらい耐久性が高いです。 
 
反対にクッションフロアは、家具跡や杖を突いた跡が残ることもあるので、耐久性は高いとはいいがたいです。 
 
最近自分が長尺シートを使った現場では、現在、もしくは将来的に杖を突く可能性もあるから丈夫な床にしたいけど、フローリングにはしたくないという方でした。そういった時には十分な耐久性がある長尺シートがおすすめです。 
 
コストはクッションフロアの方が安いですが、耐久性を考えると長尺シートの方がコストパフォーマンスが良くなる可能性もありますね。

勿論、クッションフロアも優れた床材であるのは間違いありません。 
 
長尺シートの質感は少し硬質ですが、クッションフロアはやわらかくて温かみがあります。ゆっくりしたい方が多い住宅ではあたたかみのある空間の方が好まれやすいです。実際に、住宅リフォームで特に理由もなく長尺シートが選ばれることがすくないのも、コストと質感を考慮した結果なのだと思います。